项目管理部主要负责拟定计划生育协会项目工作规划和年度计划并组织实施；负责“三结合”项目的项目审核、资金发放、工作督查、资金回收、项目绩效评估等工作；负责承办中国计划生育协会，联合国人口基金会、国际计生联等国内、国际非政府组织援助的项目，管好用好项目资金；负责计划生育家庭系统保险的组织、宣传、评估等工作。